1、繼發性巫山肝癌:繼發性巫山肝癌與原發性巫山肝癌比較,繼發性巫山肝癌病情發展緩慢,症狀較輕,其中以繼發于巫山胃癌的最多,其次為肺、胰腺、乳腺和結腸等的癌竈常轉移至肝。常表現為多個結節型病竈,甲胎蛋白(AFP)檢測除少數原發癌在消化的病例可陽性外,一般多為陰性。
2、肝硬化:巫山肝癌多發生在肝硬化的基礎上,兩者鑒别常有困難。鑒别在于詳細病史、體格檢查聯系實驗室檢查。肝硬化病情發展較慢有反複,肝功能損害較顯著,血清甲胎蛋白(AFP)陽性多提示癌變。
3、活動性肝病:以下幾點有助于巫山肝癌與活動性肝病(急慢性肝炎)的鑒别。AFP甲胎球蛋白檢查和SGPT谷丙轉氨酶必需同時檢測。

4、肝膿腫:表現發熱、肝區疼痛、有炎症感染症狀表現,白血球數常升高,肝區叩擊痛和觸痛明顯,左上腹肌緊張,周圍胸腔壁常有水腫。
5、肝海綿狀血管瘤:該病為肝内良性占位性病變,常因查體B型超聲或核素掃描等偶然發現。該病我國多見。鑒别診斷主要依靠甲胎蛋白測定,B型超聲及肝血管造影。
6、肝包蟲病:病人有肝髒進行性腫大,質地堅硬和結節感、晚期肝髒大多數被破壞,臨床表現極似原發性巫山肝癌。
7、鄰近肝區的肝外腫瘤:如胃癌、上腹部高位腹膜後腫瘤,來自腎、巫山胰腺癌、腹膜後腫瘤、腎上腺和結腸等容易與原發性巫山肝癌相混淆。除甲胎蛋白多為陰性可助區别外,病史、臨床表現不同,特别超聲、CT、腸胃道X線檢查和MRI等影像學檢查等均可作出鑒别診斷。
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